两个多月女宝尿路感染，医生说要打抗生素两星期？！

宝刚开始发烧38.6，因为太小，不敢随便用药，伴随偶尔大哭，来医院，医生就让住院打抗生素，当天就退烧了，查尿，说尿路感染，要打抗生素（头孢）7至10天，回家还要继续吃抗生素药。这么小得宝宝用这么多抗生素好吗？会影响她的免疫力吗？有经验的宝妈帮帮忙，我应该听医生的吗？