目前仍不十分清楚引起小儿心脏发育畸形的根本原因，但归纳起来肯定和以下几个因素有关：
1、胎儿先天性心脏病原因胎儿心脏某部分发育到较低的阶段即停止，或由于发育的过程考试，大收集整理中发生了轴转的错误，如大血管易位。
2、小儿出生后，仍长期留存一部分胎儿期所需要的特殊心血管通路，如动脉导管未闭等。
3、胎儿先天性心脏病原因母亲的疾病往往影响胎儿发育，母亲在妊娠最初3个月内被病毒感染，尤其是风疹病毒，则小儿易发生心脏畸形。
4、母亲在怀孕期间吃了某些药物，也可以导致胎儿心脏畸形。
5、某些可导致先天性心脏病的遗传因素。
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哪些孕妇易生出患有先天性心脏病的宝宝呢？
妊娠前3个月有感染或服药史；长期接触毒物及放射线史；患有血液病、内分泌病、结缔组织疾病、心血管疾病或遗传病；有心内、心外畸形的不良生育史，有心脏病家族史；检查已证实或怀疑胎儿有心内、心外畸形或染色体异常；宝宝宫内发育异常，羊水过多或过少；胎儿心率过快、过慢或节律不齐。
先天性心脏病要分三级预防。首先，在孕前和怀孕早期，女性要预防感冒，少接触电脑，加强营养，慎重用药；其次，在胎儿期母亲要及时做相关检查；最后才是选择为孩子手术。
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目前环境因素是造成我国小儿先天性心脏病的主要因素，如孕妇接触放射和重金属，在工作中接触有机溶剂及吸烟、饮酒等均与发病有关。另外，缺氧环境也可能是发病的因素。
虽然引起小儿心脏发育畸形的根本原因目前仍不十分清楚，但改善环境因素，做好孕期(特别是怀孕早期)的保健对预防小儿先天性心脏病的发生尤为重要。
孕妇的居住空间应空气新鲜、阳光充足，严禁接触放射性物质，避免在空气污染较重的环境中工作和生活；食用新鲜蔬菜应该用清水多次浸泡以便减少残余农药；不吸烟、不饮酒。
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